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MilliporeSigma

A2929

Agarose

For pulsed field electrophoresis running gel

Synonyme(s) :

3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan

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A propos de cet article

Numéro CAS:
UNSPSC Code:
41105317
PubChem Substance ID:
EC Number:
232-731-8
NACRES:
NA.25
MDL number:
Service technique
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biological source

algae (red)

Quality Level

form

powder

technique(s)

electrophoresis: suitable

impurities

≤10% water

EEO

≤0.10

transition temp

gel point 38-43 °C (10% gel)

gel strength

≥2000 g/cm2

anion traces

sulfate (SO42-): ≤0.20%

foreign activity

DNase, RNase, NICKase, none detected

SMILES string

O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O

InChI

1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1

InChI key

MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Application

Especially formulated for fast resolution of large DNA (10-2000 ·kb) by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) or conventional electrophoresis. Pulsed-field gel electrophoresis was developed in 1984 to deal with "reptation" of large DNA′s whose size surpass the limit of resolution and all migrate at the same rate. Alternately pulsed, orthogonally oriented electric fields are applied across the gel. Every time the direction of the electric field changes, the large DNA′s can no longer migrate until they become reoriented along the new electric field. The time required for reorientation is dependent on the size of the DNA, therefore the DNA is fractionated by size.

Biochem/physiol Actions

Suitable for the separation of high molecular weight DNA. Gels are easy to handle and give faster separation and better resolution of high molecular weight DNA by field inversion electrophoresis than our routine-use agarose.

Features and Benefits

  • Low EEO allows for increased voltages and more rapid DNA migration
  • Greater gel strength allows for stability of lower concentration gels leading to faster DNA migration
  • Gels exhibit low background fluorescence using ethidium bromide staining

Analysis Note

Nos agaroses ont les propriétés suivantes :
Teneur en sulfates : sert d'indicateur de pureté, le sulfate étant le principal groupement ionique présent.
Force du gel : équivaut à la force qu'il faut appliquer sur le gel pour le rompre.
Point de gélification : correspond à la température à laquelle une solution aqueuse d'agarose forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lorsqu'elles passent de la forme liquide à la forme gélifiée, ce qui signifie que leur point de gélification n'est pas égal à leur température de fusion.
Électro-endosmose (EEO) : définit un mouvement de liquide à travers le gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas bouger, mais les contre-ions positifs dissociables peuvent migrer dans la matrice en direction de la cathode, créant ainsi une EEO. Comme le déplacement électrophorétique des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut perturber les séparations en raison d'une convection interne.


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Classe de stockage

11 - Combustible Solids

wgk

WGK 3

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable

ppe

Eyeshields, Gloves, type N95 (US)



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Yu-Hsuan Cheng et al.
BMC biology, 18(1), 180-180 (2020-12-01)
Ciliates are an ancient and diverse eukaryotic group found in various environments. A unique feature of ciliates is their nuclear dimorphism, by which two types of nuclei, the diploid germline micronucleus (MIC) and polyploidy somatic macronucleus (MAC), are present in
Julia Dahlmann et al.
Biomaterials, 34(10), 2463-2471 (2013-01-22)
In most pluripotent stem cell differentiation protocols the formation of embryoid bodies (EBs) is an important step. Here we describe a rapid, straightforward soft lithography approach for the preparation of hydrophilic silicon masters from different templates and the subsequent production
Markus Landthaler et al.
RNA (New York, N.Y.), 14(12), 2580-2596 (2008-11-04)
microRNAs (miRNAs) regulate the expression of mRNAs in animals and plants through miRNA-containing ribonucleoprotein particles (RNPs). At the core of these miRNA silencing effector complexes are the Argonaute (AGO) proteins that bind miRNAs and mediate target mRNA recognition. We generated



Numéro d'article de commerce international

RéférenceGTIN
A2929-100G04061833359976
A2929-250G04061833616932
A2929-25G04061833608128